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가상오믹스 · VIRTUAL OMICS

화합물만 넣으면,
예상 변화 수치가 나옵니다

실제로 먹여보기 전에 먹인 뒤의 유전자 변화를 계산해서 보여 드립니다. 실험 한 건에 수천만 원과 수개월이 드는 자리를 몇 분으로 옮깁니다. 될 만한 것만 골라서 실험하십시오.

  • 어떤 물질이든 답합니다 — 실험 데이터에 없는 신규 물질도
  • 유전자별 변화량 · 켜지고 꺼진 경로 · 판정까지 한 번에
  • 근거가 실측인지 추정인지 답마다 표시합니다
  • 한 번도 본 적 없는 골격으로만 시험해 검증했습니다

설치 없이 브라우저에서 바로 · 결과마다 근거와 한계를 함께 표시

  1. 물질 · 조건
  2. 투여 후 전사체
  3. 움직인 유전자
  4. 경로 · 판정
화합물과 표적에서 출발한 신호가 경로·전사조절 네트워크를 따라 퍼져 유전자 발현 변화와 통계 검정 결과로 이어지는 4단계 도식 왼쪽에서 화합물 구조가 표적 단백질에 결합하고, 그 신호가 경로와 전사조절 네트워크의 간선을 따라 단계적으로 퍼집니다. 이어서 가운데의 유전자 발현 히트맵이 상향(민트)·하향(파랑)·변화 없음(흐림)으로 정렬되어 나타나고, 오른쪽 볼케이노 도식에서 유의성 기준선을 넘긴 유전자만 남습니다. 유의 23개 · q < 0.05
상향 하향 변화 없음 경로 전파 개념 도식입니다 · 실제 실행 결과가 아닙니다

왜 필요한가

마커 몇 개만 보고 다음 단계를 결정합니다

투여 전후를 실제로 재려면 조건 하나에 수천만 원과 수개월이 듭니다. 그래서 실제로 보는 것은 많아야 마커 수십 개이고, 나머지 유전자·경로는 못 본 채로 넘어갑니다. 물질 × 용량 × 시점 × 조직을 곱하면 조건은 금세 수백 가지가 됩니다.

지금

  • 후보를 좁힐 근거가 문헌과 감(感)입니다
  • 조건 하나 확인에 수개월
  • 틀린 후보를 끝까지 끌고 간 뒤에 압니다

가상오믹스를 쓰면

  • 후보 전부를 같은 자로 미리 비교합니다
  • 조건 하나에 몇 분, 라이브러리 하나에 하룻밤
  • 걸러낸 뒤에 실험하므로 실험 횟수가 줄어듭니다

자동차 충돌 안전시험이 겪은 변화와 같습니다. 예전에는 진짜 차를 부숴봐야 알았지만, 지금은 컴퓨터로 수천 번 부숴본 뒤 실물은 마지막 한 번만 부숩니다.

지식베이스 규모

모두 지금 서버에 실제로 적재된 값입니다. 읽어오지 못한 항목은 임의의 숫자로 채우지 않고 감춥니다.

HOW IT RUNS

넣는 것 넷, 나오는 것 넷

넣는 것
  • SMILES물질 구조
  • Cell line세포주
  • µM용량
  • h시점
나오는 것
  • 전량유전자별 변화량 · 오르내림
  • 1,251겹친 경로 · 방향
  • 6 × 4용량-반응 · 시간 경과
  • 1답해도 되는지 판정

한 번 누르면 1~3초. 같은 일을 습식으로 하면 조건 한 칸에 수개월과 수천만 원이 듭니다.

어디까지 되나

되는 것과 아직 안 되는 것을 그대로 적습니다

계산 결과는 실험을 대신할 후보를 좁히는 용도입니다. 실험을 없애는 것이 아니라, 실험을 어디에 쓸지 정하는 데 씁니다.

지금 됩니다

  • 신규 물질도 답합니다실험 데이터에 없는 물질은 구조에서 계산합니다. 한 번도 본 적 없는 골격만 따로 떼어 시험했습니다.
  • 기전이 알려진 약물을 맞혔습니다학습에 넣지 않은 약물에서, 그 약이 실제로 건드리는 경로를 상위권으로 짚어 냈습니다. 열 건 중 여섯 건에서 「아무 물질에나 나오는 일반적인 답」보다 정확했습니다.
  • 근거 등급을 표시합니다실측을 찾아 답한 것인지 구조로 추정한 것인지 결과마다 구분해 적습니다.

아직 안 됩니다

  • 세포·동물 검증은 아직입니다계산으로 뽑은 후보가 실제 실험에서 맞는지는 아직 확인하지 않았습니다. 지금 진행 중인 과제가 바로 그 검증입니다.
  • 실험을 대체하지 않습니다마지막 확인은 여전히 실험입니다. 우리가 줄이는 것은 확인해야 할 후보의 수입니다.
  • 잰 범위 밖은 외삽하지 않습니다측정해 본 조건을 벗어나면 그렇다고 화면에 적고, 억지로 답을 만들지 않습니다.

이 페이지의 수치는 모두 실제 적재된 데이터와 검증 결과에서 가져옵니다. 읽어오지 못한 값은 임의의 숫자로 채우지 않고 감춥니다.

WHERE IT PLUGS IN

엔진은 하나, 입력만 다릅니다

진단

질환·노화 상태를 가르는 분자 지표를 후보 단계에서 선별

입력 · 유전자 목록

치료

노화 기전에 개입하는 표적과 물질을 실측 녹아웃에서 도출

입력 · 표현형 반응 패턴

신약

후보 라이브러리를 걸러 동물실험에 들어갈 물질 수를 줄임

입력 · 화합물 라이브러리

건기식

원료 효능 근거를 분자 수준에서 만들어 인체적용시험을 보완

입력 · 원료 구조

DEEP DIVE

근거를 직접 확인하고 싶다면

어떻게 검증했는지, 무엇과 비교했는지, 그리고 통과하지 못한 시험까지 자르지 않고 한 페이지에 모아 뒀습니다.

  • 방법론 — 구조에서 통계까지 전 단계
  • 두 다리 비교 — 신경망 · 구조검색 · 블렌드
  • 「건드릴 표적 찾기」 성적과 그 한계
  • 실험 검증 프로토콜 자동 설계
  • 쓰임과 한계 · 신뢰성 · 참고문헌
기술 상세 열기

START HERE

지금 첫 실험을 돌려보세요

화합물 하나와 조직 하나만 고르면 됩니다. 유전자별 변화량 · 경로 · 근거 등급, 그리고 다음에 무엇을 실험하면 되는지까지 함께 나옵니다.

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